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高通量測(cè)序分析不同地區(qū)紅腐乳細(xì)菌多樣性
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 158 發(fā)表時(shí)間: 2020-05-25
作者: 徐瓊,劉洋,曲勤鳳,竇同海,陳羽菲,張娜娜,趙磊,鐘江,翁史昱,楊捷琳,趙國(guó)屏
關(guān)鍵詞: 高通量測(cè)序;紅腐乳;細(xì)菌多樣性
摘要:

為了解我國(guó)傳統(tǒng)發(fā)酵食品紅腐乳中細(xì)菌的多樣性及其微生物安全性,采用高通量測(cè)序技術(shù),分析華東、華北和東北地區(qū)紅腐乳中細(xì)菌16S rDNA V1-V3區(qū)基因序列,比較不同地區(qū)紅腐乳中微生物群落結(jié)構(gòu)組成及多樣性差異。結(jié)果顯示,本次測(cè)序深度有效地覆蓋了樣品中微生物種類,不同地區(qū)紅腐乳樣品中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)具有豐富多樣性。在門水平上,厚壁菌門(Firmicutes)、放線菌門(Actinobacteria)和變形菌門(Proteobacteria)為不同地區(qū)紅腐乳種主要優(yōu)勢(shì)菌的門;而在屬水平上,9 個(gè)紅腐乳樣品共檢測(cè)出296 個(gè)細(xì)菌屬,其中共有菌屬分別為:棒狀桿菌屬(Corynebacterium)、四聯(lián)球菌屬(Tetragenococcus)、明串珠菌屬(Leuconostoc)、Rummeliibacillus屬、乳球菌屬(Lactococcus)、魏斯氏菌屬(Weissella)、鏈球菌屬(Streptococcus)、叢毛單胞菌屬(Comamonas)、芽孢桿菌屬(Bacillus)以及Trabulsiella屬。不同樣品中菌群的結(jié)構(gòu)與地區(qū)存在一定的聚類關(guān)系:明串珠菌屬、乳球菌屬以及四聯(lián)球菌屬是華北地區(qū)樣品中主要的優(yōu)勢(shì)菌屬,而東北地區(qū)腐乳樣品中的芽孢桿菌屬和鹽厭氧菌屬為主要優(yōu)勢(shì)菌屬。研究結(jié)果加深了對(duì)紅腐乳中細(xì)菌群落組成和多樣性的認(rèn)識(shí),為保證傳統(tǒng)發(fā)酵食品的質(zhì)量安全、生產(chǎn)工藝提供一定的理論支持。

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