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鴨梨DHN3基因鑒定及在果心褐變中的表達(dá)分析
來(lái)源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 157 發(fā)表時(shí)間: 2023-07-10
作者: 寇曉敏,李慶秀,李玲,張陳云,閆師杰,梁麗雅,鄧冰
關(guān)鍵詞: 鴨梨;褐變;脫水素;基因鑒定;生物信息學(xué)分析
摘要:

為探究脫水素(dehydrin,DHN)蛋白與晚采鴨梨(Pyrus bretschneideri Rehd.)果心褐變之間的關(guān)系,基于生物信息學(xué)方法對(duì)鴨梨PbDHN3基因進(jìn)行鑒定和特性分析,并分析急速降溫和緩慢降溫條件下晚采鴨梨果心褐變發(fā)生過(guò)程中PbDHN3基因的表達(dá)模式。結(jié)果表明,PbDHN3開(kāi)放閱讀框564 bp,編碼187 個(gè)氨基酸,且具有DHN的Dehydrin superfamily保守結(jié)構(gòu)域,含有2 個(gè)Y片段、1 個(gè)S片段、3 個(gè)K片段,屬于Y2SK3型DHN。生物信息學(xué)分析表明PbDHN3分子質(zhì)量19.77 kDa,等電點(diǎn)7.98,為親水性穩(wěn)定蛋白;二級(jí)結(jié)構(gòu)包含α-螺旋、無(wú)規(guī)卷曲、延伸鏈和β-轉(zhuǎn)角,且定位于細(xì)胞核,不含信號(hào)肽與跨膜結(jié)構(gòu),為非分泌蛋白。同源性分析結(jié)果表明PbDHN3與蘋(píng)果等5 種植物的DHN相似性達(dá)到89.74%以上,系統(tǒng)發(fā)育分析顯示PbDHN3和P. ussuriensis×P. communis的DHN親緣關(guān)系最近。啟動(dòng)子分析結(jié)果表明PbDHN3含有基本啟動(dòng)子元件和其他順式作用元件,與陸地棉GhDHN1及小麥TaDHN2啟動(dòng)子區(qū)預(yù)測(cè)結(jié)果一致,都包含激素響應(yīng)元件、光響應(yīng)元件等。實(shí)時(shí)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)分析結(jié)果表明,急速降溫條件下鴨梨果心部位DHN3基因在褐變過(guò)程中呈顯著上調(diào)表達(dá),與果心褐變緊密相關(guān),為進(jìn)一步探究該基因的功能,明確鴨梨果心褐變發(fā)生機(jī)制提供理論依據(jù)。

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