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蛹蟲(chóng)草轉(zhuǎn)錄組分析及類胡蘿卜素生物合成相關(guān)基因的挖掘
來(lái)源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 136 發(fā)表時(shí)間: 2021-04-09
作者: 婁海偉,趙玉,趙逸,林俊芳,趙仁勇,葉志偉,郭麗瓊
關(guān)鍵詞: 蛹蟲(chóng)草;高通量測(cè)序;轉(zhuǎn)錄組;色素;類胡蘿卜素;差異表達(dá)基因
摘要:

基于培養(yǎng)基顯著影響蛹蟲(chóng)草類胡蘿卜素的生成,采用高通量測(cè)序技術(shù)探究不同培養(yǎng)基培養(yǎng)的蛹蟲(chóng)草菌絲(CM10_RL和CM10_WL)的轉(zhuǎn)錄組差異,經(jīng)生物信息學(xué)分析挖掘蛹蟲(chóng)草類胡蘿卜素的生物合成相關(guān)基因。結(jié)果表明,樣品CM10_WL的類胡蘿卜素含量顯著高于樣品CM10_RL的類胡蘿卜素含量;相對(duì)于樣品CM10_RL,在樣品CM10_WL中檢測(cè)到318 個(gè)上調(diào)表達(dá)基因和618 個(gè)下調(diào)表達(dá)基因。基因本體論功能富集結(jié)果表明差異表達(dá)基因(differentially expressed gene,DEG)主要富集在代謝過(guò)程、細(xì)胞膜、催化活性條目中。京都基因與基因組百科全書(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集結(jié)果表明DEG主要富集在代謝途徑。蛹蟲(chóng)草轉(zhuǎn)錄本與KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)中的類胡蘿卜素生物合成途徑比對(duì)結(jié)果表明基因CCM_06728和CCM_09155參與類胡蘿卜素的生物合成。本研究為進(jìn)一步闡明蛹蟲(chóng)草類胡蘿卜素的生物合成途徑奠定基礎(chǔ)。

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