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芽孢桿菌植酸酶基因的克隆及生物信息學分析
來源:食品科學網 閱讀量: 138 發(fā)表時間: 2017-06-07
作者: 許 偉,仇 明,余曉紅,封功能,邵 榮
關鍵詞: 同源建模|植酸酶基因|克隆
摘要:

采用PCR技術從Bacillus amyloliquefaciens DSM 1061中克隆到植酸酶的全長基因phyC(1152bp),并將該基因成功克隆到表達載體pET22b(+),經PCR鑒定和DNA測序證明,pET22b(+)-phyC重組質粒構建成功。將該酶的氨基酸序列在Swiss-prot數(shù)據(jù)中進行BLAST比對發(fā)現(xiàn),該序列未見報道,其與來自Bacillus subtilis的植酸酶序列(Swiss-prot ID: O31097)最相似,序列一致性為98.7%。分析可知該氨基酸序列在位點為128、144、153、257和370處分別變異為Ala、Ile、Ser、Pro和Lys。運用SignalP 3.0服務器對其信號肽進行預測,表明該酶N端1~26個殘基可能是信號肽序列。運用SWISS-MODEL服務器進行同源建模,經PROCHECK V3.5軟件對其Ramachandran plot、G-factor等進行評價,結果顯示結構模型中的鍵長、鍵角及二面角的分布及結構合理。該基因已在GenBank上登錄(登錄號為HM747163)。

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