領(lǐng)學(xué)術(shù)科研之先，創(chuàng)食品科技之新
—— 中國(guó)食品雜志社
以45 株食源性沙門氏菌喹諾酮耐藥株為對(duì)象，采取全基因組測(cè)序和實(shí)時(shí)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)（real-time polymerase chain reaction，real-time PCR）法檢測(cè)parC、gyrA基因突變位點(diǎn)，并對(duì)檢測(cè)方法可靠性、耐藥基因突變特征進(jìn)行評(píng)估和分析。首先將4 株沙門氏菌進(jìn)行二代全基因組測(cè)序，根據(jù)測(cè)序數(shù)據(jù)分析結(jié)果，建立了一種real-time PCR法檢測(cè)gyrA Asp87Tyr、gyrA Asp87Asn、parC Thr57Ser和parC Ser80Ile這4 個(gè)突變位點(diǎn)。將沙門氏菌進(jìn)行qnrS、qnrA、qnrB的real-time PCR檢測(cè)，發(fā)現(xiàn)有31 株菌未檢出qnr基因。以這31 株菌為對(duì)象，采取real-time PCR法篩查基因突變位點(diǎn)，結(jié)果發(fā)現(xiàn)parC Thr57Ser和gyrA Asp87Asn型突變最常見。將real-time PCR陽(yáng)性的10 株菌擴(kuò)增parC、gyrA基因全長(zhǎng)并測(cè)序，real-time PCR檢測(cè)和測(cè)序結(jié)果完全吻合，說(shuō)明了real-time PCR檢測(cè)的可靠性。全基因組測(cè)序和real-time PCR法相結(jié)合的方法用于耐藥基因突變篩查，既可以發(fā)現(xiàn)新的基因突變，又可以快速篩查大樣本的主要突變類型，可作為沙門氏菌耐藥性研究的一種可靠手段。
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