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基于多位點(diǎn)序列分型對新疆人及動(dòng)物食品源性糞腸球菌種群進(jìn)化關(guān)系解析
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 181 發(fā)表時(shí)間: 2023-01-03
作者: 張雪玲,袁麗霞,張慧敏,田豐偉,倪永清
關(guān)鍵詞: 糞腸球菌;多位點(diǎn)序列分型;遺傳多樣性;克隆復(fù)合群;種群結(jié)構(gòu)
摘要:

從母乳、奶酪、馬奶、駝奶以及冷水魚腸道中共分離得到59 株糞腸球菌。通過多位點(diǎn)序列分型技術(shù)分析不同來源分離株的種群結(jié)構(gòu)和進(jìn)化關(guān)系。結(jié)果表明,59 株分離株被劃分為12 個(gè)序列型,3 個(gè)克隆復(fù)合體和3 個(gè)獨(dú)特型,沒有序列型被劃分為高風(fēng)險(xiǎn)克隆復(fù)合體。持家基因分裂分解分析結(jié)果顯示,基因重組在糞腸球菌進(jìn)化過程中發(fā)揮了重要的作用。通過最小生成樹分析發(fā)現(xiàn),糞腸球菌遺傳關(guān)系與分離地區(qū)的相關(guān)性較弱。盡管eBURST和系統(tǒng)發(fā)育分析表明母乳源和冷水魚源的糞腸球菌具有一定的宿主特異性,但在奶酪、駝奶和馬奶中仍然可以檢測到與其密切相關(guān)的糞腸球菌克隆。結(jié)果表明,來自不同宿主的糞腸球菌將適應(yīng)新的生態(tài)位,并通過生產(chǎn)實(shí)踐和食物鏈傳播。為減少人畜共患病的潛在風(fēng)險(xiǎn),有必要進(jìn)行持續(xù)監(jiān)測。

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