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嗜熱鏈球菌KLDS3.1012胞外多糖合成途徑的基因組學(xué)及表型特征分析
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 151 發(fā)表時(shí)間: 2019-06-11
作者: 李柏良,趙 莉,王成鳳,靳 妲,丁秀云,劉 飛,霍貴成
關(guān)鍵詞: 嗜熱鏈球菌;基因組測(cè)序;生物信息分析;糖代謝;胞外多糖
摘要:

在分子水平上挖掘嗜熱鏈球菌KLDS3.1012合成胞外多糖的途徑并且通過表型特征進(jìn)行驗(yàn)證。首先,基于Illumina HiSeq與Illumina MiSeq測(cè)序平臺(tái)對(duì)菌株KLDS3.1012進(jìn)行基因組測(cè)序并構(gòu)建基因組圖譜;隨后,從糖代謝、糖核苷酸合成、胞外多糖基因簇等方面進(jìn)行生物信息學(xué)分析;最后,利用API 50CH測(cè)定菌株KLDS3.1012的糖發(fā)酵情況及采用高效離子交換色譜法測(cè)定胞外多糖的單糖組成。生物信息學(xué)分析結(jié)果表明菌株KLDS3.1012具有半乳糖、葡萄糖、果糖、甘露糖、乳糖和蔗糖轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)和4 種糖核苷酸(UDP-葡萄糖、dTDP-鼠李糖、UDP-半乳糖和UDP-N-乙酰葡糖胺)合成的相關(guān)基因及1 個(gè)胞外多糖合成基因簇。表型特征分析結(jié)果表明菌株KLDS3.1012可以利用以上6 種碳源并能形成由鼠李糖、半乳糖和葡萄糖組成的胞外多糖。本研究為分析該菌株合成胞外多糖的遺傳基礎(chǔ)與胞外多糖結(jié)構(gòu)的關(guān)系提供理論依據(jù),并對(duì)將其開發(fā)為發(fā)酵劑具有一定指導(dǎo)意義。

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