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—— 中國食品雜志社
在使用引物27F/338R、338F/806R和515F/907R分別對細菌16S rRNA基因的V1～V2區(qū)、V3～V4區(qū)和V4～V5區(qū)進行擴增的基礎上，采用MiSeq高通量測序評價擴增區(qū)域?qū)噺V椒細菌多樣性分析結(jié)果的影響。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，擴增16S rRNA基因V4～V5區(qū)的非特異性序列所占比例顯著偏低（P＜0.05），而擴增V1～V2區(qū)樣品細菌的Chao1指數(shù)顯著偏高（P＜0.05）。雖然擴增16S rRNA基因的V3～V4區(qū)會導致Cyanobacteria（藍細菌門）和Pediococcus（小球菌）相對含量顯著偏高（P＜0.05），但不同擴增區(qū)域擴增出的同一樣品其微生物群落結(jié)構(gòu)無顯著差異（P＞0.05）。在對鲊廣椒細菌多樣性進行解析時，建議選擇引物515F/907R擴增16S rRNA基因的V4～V5區(qū)。
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