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水產(chǎn)品中創(chuàng)傷弧菌ddPCR定量方法的建立
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 221 發(fā)表時間: 2020-06-29
作者: 馬丹,魏詠新,李丹,魏海燕,徐蕾蕊,汪琦,付溥博,張西萌,曾靜
關(guān)鍵詞: 微滴數(shù)字聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng);創(chuàng)傷弧菌;實時熒光聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)
摘要:

選取創(chuàng)傷弧菌單拷貝基因met為靶基因,設(shè)計引物探針,建立對創(chuàng)傷弧菌準(zhǔn)確定量的微滴式數(shù)字聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(droplet digital polymerase chain reaction,ddPCR)方法,并進(jìn)行特異性、靈敏度和重復(fù)性實驗,同時與實時PCR(real-time PCR)方法進(jìn)行比較。結(jié)果顯示,所建立的ddPCR方法可以快速、高效地檢測出創(chuàng)傷弧菌,細(xì)菌純培養(yǎng)物中其定量限可達(dá)323 拷貝數(shù)/mL,檢測限可達(dá)61 拷貝數(shù)/mL,人工污染牡蠣樣品中能最低能檢測到1.13×102 拷貝數(shù)/g的目標(biāo)菌。對人工污染樣品中目標(biāo)菌的檢測,ddPCR的定量結(jié)果約為平板計數(shù)結(jié)果的1.4 倍,比real-time PCR方法的檢測更加穩(wěn)定準(zhǔn)確。本研究建立的ddPCR檢測方法能快速準(zhǔn)確、特異、靈敏地定量檢測創(chuàng)傷弧菌。

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