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風(fēng)干肉中產(chǎn)脂肪酶瑞士乳桿菌TR13全基因組測(cè)序及序列分析
來(lái)源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 133 發(fā)表時(shí)間: 2020-09-23
作者: 田建軍,張開(kāi)屏,趙艷紅,李權(quán)威,馬牧然,馬俊杰,曹凱慧,靳燁
關(guān)鍵詞: 瑞士乳桿菌;全基因組測(cè)序;基因功能注釋
摘要:

瑞士乳桿菌TR13是從自然風(fēng)干羊肉中分離篩選到的1 株產(chǎn)脂肪酶活性高的菌株,為能夠更好地研究該菌株在羊肉發(fā)酵過(guò)程中的代謝機(jī)理和功能,采用PacBio Illumina HiSeq測(cè)序平臺(tái)對(duì)細(xì)菌TR13進(jìn)行完成圖測(cè)序分析。結(jié)果表明,瑞士乳桿菌TR13基因組為1 套環(huán)狀無(wú)質(zhì)粒分子,基因組序列總長(zhǎng)度為2 172 224 bp,GC含量為36.82%。基因組中預(yù)測(cè)到2 536 個(gè)編碼基因,編碼基因總長(zhǎng)度為1 883 532 bp,平均長(zhǎng)度為799.46 bp,平均密度為1.08 個(gè)/kb,對(duì)應(yīng)蛋白質(zhì)平均序列長(zhǎng)度為265 aa,占基因組百分比為86.71%。TR13菌株基因組中包含15 個(gè)rRNA操縱子和63 個(gè)tRNA。預(yù)測(cè)到可能的毒力基因75 個(gè),耐藥基因150 個(gè)。編碼基因通過(guò)GO、COG和KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)的對(duì)比分析,完成了TR13菌株基因組基本功能注釋和代謝通路基因信息注釋,注釋信息可為菌株應(yīng)用研究提供一定理論依據(jù)。

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