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基于DNA條形碼技術(shù)鑒別有毒鵝膏菌屬物種
來(lái)源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 218 發(fā)表時(shí)間: 2021-03-15
作者: 白文明,邢冉冉,陳麗萍,彭濤,雷紅濤,陳穎
關(guān)鍵詞: 鵝膏菌屬;DNA條形碼;物種鑒別
摘要:

收集27?個(gè)鵝膏菌屬物種共38?份樣本,提取樣品基因組DNA,應(yīng)用通用引物擴(kuò)增其內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(internal transcribed spacer,ITS)、核糖體大亞基(large ribosomal subunit,LSU)、RNA聚合酶的第二大亞基(the second largest subunit of RNA polymerase II,RPB2)、β-微管蛋白(β-tubulin)基因序列并進(jìn)行Sanger雙向測(cè)序,將得到的序列進(jìn)行校對(duì)拼接后與NCBI的GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中的參考序列進(jìn)行比對(duì)鑒別物種來(lái)源;計(jì)算物種的種內(nèi)、種間Kimura-2-Parameter(K2P)遺傳距離并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。結(jié)果表明,β-tubulin、ITS基因序列鑒別能力優(yōu)于RPB2、LSU基因序列,可將β-tubulin與ITS兩者聯(lián)合用于鵝膏菌屬的物種鑒別,為有毒蘑菇誘發(fā)的食源性中毒風(fēng)險(xiǎn)進(jìn)行預(yù)警。β-tubulin基因序列長(zhǎng)度較LSU、ITS、RPB2等基因序列短,適合對(duì)深加工的蘑菇制品以及誤食毒蘑菇后的嘔吐物進(jìn)行分析,可作為鵝膏菌屬中毒事件中物種鑒定及溯源的優(yōu)選條形碼。

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