領(lǐng)學(xué)術(shù)科研之先，創(chuàng)食品科技之新
—— 中國食品雜志社
對來源于NCBI 公共數(shù)據(jù)庫的12144 條香菇(Lentinus edodes)EST 序列進行簡單重復(fù)序列SSR 搜索。結(jié)果表明：在這些香菇EST 序列中共有359 個SSR 位點，46 種SSR 的重復(fù)單元，其中2 堿基重復(fù)243 條(67.69%)，3 堿基重復(fù)114 條(31.76%)，5 堿基重復(fù)1 條(0.28%)，6 堿基重復(fù)1 條(0.28%)。平均33.8 條EST 序列中有1 個SSR。SSR的堿基總數(shù)達7727kb，約占整個EST 序列堿基數(shù)的2.94%。本實驗還根據(jù)搜索結(jié)果設(shè)計了100 條香菇EST-SSR 引物，并隨機合成了20 對引物。以4 個野外采集的香菇DNA 為模板，對引物進行了篩選與評價，有16 對引物有較清晰且穩(wěn)定的目標擴增產(chǎn)物，其中11 對引物的產(chǎn)物存在遺傳多態(tài)性。結(jié)果表明本實驗設(shè)計開發(fā)的香菇的EST-SSR標記是可行且有效的。
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