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1 株新的變形桿菌噬菌體的分離、鑒定與生物學(xué)特性分析
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 170 發(fā)表時(shí)間: 2023-10-30
作者: 蘇雅航,侯忠余,寇肖迪,劉爽,朱成林,陳娟,刀筱芳,唐俊妮
關(guān)鍵詞: 變形桿菌;噬菌體;生物學(xué)特性;基因組分析
摘要:

目的:對(duì)1 株新的變形桿菌(Proteus)噬菌體進(jìn)行分離、鑒定與生物學(xué)特性及基因組分析。方法:將實(shí)驗(yàn)室從牦牛屠宰環(huán)節(jié)中分離到的菌株純培養(yǎng)后,對(duì)其DNA提取進(jìn)行16S rRNA測(cè)序,鑒定獲得宿主菌,采集四川成都牦牛屠宰場(chǎng)環(huán)境污水,以獲得的宿主菌進(jìn)行噬菌體分離;運(yùn)用雙層瓊脂平板法進(jìn)行噬菌體的分離純化,測(cè)定噬菌體的最佳感染復(fù)數(shù)、一步生長曲線和噬菌體耐受性等;通過磷酸負(fù)染、透射電鏡觀察噬菌體的形態(tài);采用試劑盒提取噬菌體全基因組DNA,使用Illumina MiSeq測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行噬菌體全基因組測(cè)序,對(duì)噬菌體全基因組序列進(jìn)行組裝、注釋和基因組學(xué)分析。結(jié)果:從67 株分離菌株中鑒定出10 株P(guān)roteus,并從污水中分離得到1 株可裂解變形桿菌和糞腸球菌(Enterococcus faecalis)并且裂解性較強(qiáng)的噬菌體,命名為Proteus phage PV66;其最佳感染復(fù)數(shù)為0.1,一步生長曲線結(jié)果顯示,感染宿主菌的潛伏期約為10 min,裂解期約為80 min,平均裂解量為321 PFU/cell;耐受pH值范圍為3~12,耐受溫度為65 ℃。電鏡觀察該噬菌體為C3形態(tài)噬菌體,其頭部長(140±1)nm、寬(54±2)nm,尾部長為(36±1)nm。基因組測(cè)序結(jié)果表明PV66全序列長度為90 492 bp,系統(tǒng)發(fā)育樹分析發(fā)現(xiàn)該噬菌體與奇異變形桿菌(P. mirabilis)噬菌體和克諾羅桿菌(Cronobacter)噬菌體同源性較高,與non-Kuravirus屬處于同一分支。結(jié)論:本研究分離到1 株新的變形桿菌噬菌體并具有良好的應(yīng)用潛力,為進(jìn)一步開發(fā)噬菌體類新型抗菌劑提供基礎(chǔ),同時(shí)也豐富了變形桿菌噬菌體的數(shù)據(jù)庫。

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