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鼠李糖乳桿菌JAAS8胞外多糖生物合成基因的克隆及生物信息學(xué)分析
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 182 發(fā)表時(shí)間: 2017-06-07
作者: 李盛鈺,趙玉娟,張雪,戴大海,曾先鵬,張貴斌,楊貞耐
關(guān)鍵詞: 鼠李糖乳桿菌|胞外多糖|基因簇|生物合成
摘要:

根據(jù)已知乳桿菌胞外多糖生物合成基因的同源性,利用其保守區(qū)設(shè)計(jì)引物,擴(kuò)增出鼠李糖乳桿菌JAAS8磷蛋白磷酸酶基因(wzb)序列,并通過染色體步移法克隆了鼠李糖乳桿菌 JAAS8 參與胞外多糖生物合成基因簇全部序列 (19.7kb),利用生物信息學(xué)方法預(yù)測(cè)了基因簇 16個(gè)閱讀框的結(jié)構(gòu)和功能。結(jié)果表明,該序列與已報(bào)道的乳桿菌胞外多糖生物合成基因具有高度同源性。welF、welG、welH、welI、welJ和welE為合成寡糖重復(fù)單元的糖基轉(zhuǎn)移酶基因。rmlA、rmlB和rmlC基因與dTDP-L-鼠李糖前體的生物合成密切相關(guān)。wzd、wze、wzy、wzx、wzr和wzb基因預(yù)測(cè)蛋白主要參與胞外多糖合成過程中多糖鏈長(zhǎng)檢測(cè)、聚合和輸出。

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