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苦蕎類異黃酮還原酶基因(FtIRL)的克隆及序列分析
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 138 發(fā)表時(shí)間: 2017-06-07
作者: 趙海霞,李成磊,白悅辰,陳 惠,吳 琦*
關(guān)鍵詞: 苦蕎|類異黃酮還原酶|基因克隆|序列分析
摘要:

利用RT-PCR技術(shù),從苦蕎(Fagopyrum tatarium)中克隆得到類異黃酮還原酶基因(IRL)的開放閱讀框序列(ORF),命名為FtIRL。序列分析表明:FtIRL含一個(gè)長(zhǎng)942bp的ORF,編碼313個(gè)氨基酸,其氨基酸序列與金蕎異黃酮還原酶FcIFR (GenBank登錄號(hào)ABV02071)同源性最高,達(dá)到97%;與其他植物IRL同源性為44%~73%。生物信息學(xué)分析表明:FtIRL推導(dǎo)的蛋白質(zhì)含有典型的底物結(jié)合口袋和保守的NADPH結(jié)合位點(diǎn),符合短鏈脫氫酶家族的結(jié)構(gòu)特征。構(gòu)建基于氨基酸的系統(tǒng)發(fā)育樹表明,苦蕎FcIFR雖然在氨基酸序列上與其他植物的異黃酮還原酶(IFR)有較高的同源性,但其生物學(xué)功能可能更接近落葉松脂醇還原酶(PLR)。

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