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利用TAIL-PCR克隆Gluconobacter suboxydans葡萄糖脫氫酶基因及其生物信息學(xué)分析
來(lái)源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 142 發(fā)表時(shí)間: 2017-06-07
作者: 戴寶新,馮惠勇,李天明,劉天佳,劉靜文,儀 宏
關(guān)鍵詞: 葡萄糖酸;交錯(cuò)式熱不對(duì)稱PCR;弱氧化醋酸桿菌;葡萄糖脫氫酶;生物信息學(xué)
摘要:

以Gluconobacter suboxydans J菌株基因組DNA為模板,基于吡咯喹啉醌附著位點(diǎn)的保守區(qū)域設(shè)計(jì)引物,通過(guò)交錯(cuò)式熱不對(duì)稱PCR獲得編碼葡萄糖脫氫酶(glucose dehydrogenase,GDH)的全長(zhǎng)基因(gdh),并對(duì)其序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明:gdh基因全長(zhǎng)2 268 bp,編碼755個(gè)氨基酸,其蛋白序列與Gluconobacter屬的GDH具有較高的同源性。GDH的分子質(zhì)量約為81.72 ku,pI值約為5.14;GDH蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)由18.41%的α-螺旋、16.16%的延伸和65.43%的無(wú)規(guī)則卷曲3種結(jié)構(gòu)模塊組成;GDH N末端的AA 1~140區(qū)域有5個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域。

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