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醬香大曲中鏈霉菌菌株FBKL4.005全基因組測序及序列分析
來源:食品科學網(wǎng) 閱讀量: 168 發(fā)表時間: 2019-09-26
作者: 李豆南,王曉丹,羅小葉,黃魏,邱樹毅
關(guān)鍵詞: 醬香型大曲|鏈霉菌屬|(zhì)全基因組測序|基因功能注釋
摘要:

鏈霉菌FBKL4.005是本課題組前期從醬香大曲中分離得到的1 株耐高溫菌株,能夠在37~55?℃的范圍內(nèi)生長代謝,為了能夠更深入地探究該菌株在釀酒過程中的代謝機理和功能性作用,完成大曲極端微生物開發(fā)應(yīng)用,對于菌株的序列信息進行解析是最為全面高效的方式。本研究采用Illumina HiSeq 2000測序平臺對菌株FBKL4.005進行全基因組測序,共得到67?771?429?個reads,2.47?G的數(shù)據(jù)量,通過對測序數(shù)據(jù)進行拼接,得到69?個contigs,菌株整個基因組大小為9?454?406?bp,GC含量為73.03%,經(jīng)過濾處理后得到7.33?Mb的有效數(shù)據(jù)量及7?946?個注釋基因,并通過GO、COG、KEGG、NR、TCDB數(shù)據(jù)庫的比對分析,完成菌株基因組預(yù)測與基本功能的注釋,獲得的基因注釋信息為今后深入開展醬香大曲中耐高溫特性鏈霉菌類群代謝途徑及機理的研究提供了理論支持。

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