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藻藍(lán)色素蛋白抑制A549細(xì)胞活性機(jī)制的miRNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 139 發(fā)表時(shí)間: 2020-12-03
作者: 郝帥,李爽,王靜,劉媛璞,趙磊,張佳雯,王成濤
關(guān)鍵詞: 藻藍(lán)色素蛋白;A549細(xì)胞;miRNA轉(zhuǎn)錄組;細(xì)胞增殖;調(diào)控機(jī)制
摘要:

藻藍(lán)色素蛋白是我國(guó)認(rèn)可的天然食用色素,可用于多種低溫食品的著色;它同時(shí)也是一種優(yōu)良的功能性色素蛋白。許多研究表明,藻藍(lán)蛋白具有顯著的腫瘤抑制作用,能夠抑制非小細(xì)胞肺癌的增殖和遷移。為深入探究藻藍(lán)蛋白抑制非小細(xì)胞肺癌活性的調(diào)控機(jī)制,本研究以A549細(xì)胞為代表,采用高通量小分子RNA轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)對(duì)藻藍(lán)蛋白處理前后的細(xì)胞進(jìn)行miRNA的篩選分析。結(jié)果表明,已知和新預(yù)測(cè)的miRNA被成功測(cè)序;通過統(tǒng)計(jì)學(xué)分析篩選得到了136 個(gè)藻藍(lán)蛋白處理后具有表達(dá)差異的miRNA,其中74 個(gè)顯著上調(diào),62 個(gè)顯著下調(diào)。根據(jù)這些差異miRNA在不同樣本中的表達(dá)情況,可以聚類為4 類不同的表達(dá)模式;實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)對(duì)上述miRNA進(jìn)行表達(dá)量的驗(yàn)證,與轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果相吻合;此外,miRNA靶基因的Gene Ontology注釋和功能富集分析結(jié)果顯示,與細(xì)胞增殖信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)調(diào)控過程相關(guān)的靶蛋白例如PAK4、MAPK13、RASSF10等均被預(yù)測(cè)為差異miRNA的全新靶點(diǎn),可能在藻藍(lán)蛋白抑制非小細(xì)胞肺癌增殖過程中起到重要的調(diào)控作用。不同于傳統(tǒng)的mRNA轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,本研究采用小分子miRNA測(cè)序深入探究了藻藍(lán)蛋白抑制肺癌細(xì)胞生長(zhǎng)的調(diào)控機(jī)制,為抗腫瘤類功能食品因子的利用提供了理論依據(jù),同時(shí)為非小細(xì)胞肺癌的靶向治療提供了重要的理論參考。

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