領(lǐng)學(xué)術(shù)科研之先，創(chuàng)食品科技之新
—— 中國食品雜志社
以1 株產(chǎn)胞外多糖（exopolysaccharide，EPS）的嗜熱鏈球菌（Streptococcus thermophilus）IMAU20551為研究對象，提取其DNA后采用Illumina HiSeq技術(shù)對DNA進行二代基因組重測序，并利用SOAPdenovo軟件對其進行組裝，通過與RAST、直系同源集、基因本體論、京都基因與基因組百科全書等數(shù)據(jù)庫進行比對，注釋基因組中功能基因。發(fā)現(xiàn)S. thermophilus IMAU20551基因組全長1 725 107 bp，共注釋出1 884 個功能基因，其中包含一個長度為19 376 bp的完整eps基因簇，該基因簇中與EPS合成相關(guān)的基因共有18 個，主要包括epsA、epsB、epsC、epsD、epsE、eps1F、eps2F、epsJ、wzx、epsP和epsX等，這些基因分別對EPS的合成、組裝以及轉(zhuǎn)運輸出進行調(diào)控。另一方面，利用實時聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)對S. thermophilus IMAU20551 eps基因簇表達進行驗證，發(fā)現(xiàn)所有基因均可表達，且除個別糖基轉(zhuǎn)移酶基因外，其他被測基因均在6 h達到最大表達量。本研究介紹了S. thermophilus IMAU20551的基因組特征、eps基因簇及其表達能力，為今后深入研究S. thermophilus EPS基因簇及其表征結(jié)構(gòu)的互作關(guān)系奠定基礎(chǔ)。
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