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基于PCR-DGGE方法分析榨菜中乳酸菌群落結(jié)構(gòu)
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 174 發(fā)表時間: 2017-06-07
作者: 燕平梅,喬宏萍,趙文婧,單樹花,王 琪,柴 政,陳燕飛
關(guān)鍵詞: 榨菜;亞硝酸鹽;乳酸菌;聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-變性梯度凝膠電泳
摘要:

為了深入了解榨菜中的乳酸菌多樣性以及影響因素,以市場銷售含有辣椒和不含辣椒兩種袋裝榨菜為研究對象,測定榨菜中的食鹽濃度以及亞硝酸鹽含量;通過變性梯度凝膠電泳(denaturing gradient gel electrophoresis,DGGE)法分離榨菜總微生物混合16S rDNA基因V7~V8片段,采用Quantity One軟件分析乳酸菌物種豐富度、均勻度及物種多樣性指數(shù)。結(jié)果表明:含辣椒的榨菜食鹽濃度和亞硝酸鹽含量均略低于不含有辣椒的榨菜;含有辣椒和不含辣椒的榨菜兩者間物種多樣性指數(shù)、豐富度和均勻度無顯著差異(P>0.05)。通過回收DGGE電泳帶,經(jīng)克隆后測定堿基序列、與GenBank庫序列對比鑒定,不含有辣椒的榨菜5 條回收聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chainreaction,PCR)-DGGE泳帶a、b、c、d、e經(jīng)鑒定分別與Pediococcus argentinicus CRL 776、Uncultured Lactobacillus sp. isolateDGGE gel band lx12、Uncultured bacterium clone 11.02-12、Uncultured bacterium clone 11.02-9、Uncultured Lactobacillus sp.clone PxSC03相似度為98%、96%、97%、97%、97%。含有辣椒的榨菜4 條回收PCR-DGGE泳帶1、2、3、4經(jīng)鑒定分別與Uncultured Lactobacillus sp.、 Lactobacillus sakei A156、Lactobacillus sakei YY1、Lactobacillus sakei WJ1相似度為96%、97%、98%、97%。研究結(jié)果表明辣椒對榨菜中微生物群落結(jié)構(gòu)無顯著影響。

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