領(lǐng)學(xué)術(shù)科研之先，創(chuàng)食品科技之新
—— 中國(guó)食品雜志社
瑞士乳桿菌TR13是從自然風(fēng)干羊肉中分離篩選到的1 株產(chǎn)脂肪酶活性高的菌株，為能夠更好地研究該菌株在羊肉發(fā)酵過(guò)程中的代謝機(jī)理和功能，采用PacBio Illumina HiSeq測(cè)序平臺(tái)對(duì)細(xì)菌TR13進(jìn)行完成圖測(cè)序分析。結(jié)果表明，瑞士乳桿菌TR13基因組為1 套環(huán)狀無(wú)質(zhì)粒分子，基因組序列總長(zhǎng)度為2 172 224 bp，GC含量為36.82%。基因組中預(yù)測(cè)到2 536 個(gè)編碼基因，編碼基因總長(zhǎng)度為1 883 532 bp，平均長(zhǎng)度為799.46 bp，平均密度為1.08 個(gè)/kb，對(duì)應(yīng)蛋白質(zhì)平均序列長(zhǎng)度為265 aa，占基因組百分比為86.71%。TR13菌株基因組中包含15 個(gè)rRNA操縱子和63 個(gè)tRNA。預(yù)測(cè)到可能的毒力基因75 個(gè)，耐藥基因150 個(gè)。編碼基因通過(guò)GO、COG和KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)的對(duì)比分析，完成了TR13菌株基因組基本功能注釋和代謝通路基因信息注釋?zhuān)⑨屝畔⒖蔀榫陸?yīng)用研究提供一定理論依據(jù)。
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