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克羅諾桿菌MALDI-TOF-MS數(shù)據(jù)庫的建立及應(yīng)用
來源:食品科學網(wǎng) 閱讀量: 143 發(fā)表時間: 2017-06-07
作者: 趙貴明,劉 洋,陳 穎,楊海榮,趙勇勝,王 娉
關(guān)鍵詞: 克羅諾桿菌;MALDI-TOF-MS;數(shù)據(jù)庫;鑒定;分型
摘要:

應(yīng)用基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜(matrix-assisted laser desorption ionisation time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)技術(shù)建立了克羅諾桿菌MALDI-TOF-MS數(shù)據(jù)庫,用于該菌屬內(nèi)種和亞種的高通 量鑒定及菌株分型。在優(yōu)化培養(yǎng)條件、樣品處理方法及確定MALDI-TOF-MS蛋白質(zhì)指紋圖譜采集參數(shù)的基礎(chǔ)上, 將采集的8 種參考菌株蛋白質(zhì)質(zhì)譜數(shù)據(jù)通過Biotyper軟件構(gòu)建克羅諾桿菌的MALDI-TOF-MS數(shù)據(jù)庫,再用相近腸桿 菌及該屬分離株驗證數(shù)據(jù)庫的準確性。結(jié)果表明:應(yīng)用建立的克羅諾桿菌的MALDI-TOF-MS數(shù)據(jù)庫對135 株克羅 諾桿菌分離株進行分析,鑒定分值均不小于2.0,達到了種水平鑒定要求,通過聚類分析,可進一步分型。構(gòu)建的 MALDI-TOF-MS數(shù)據(jù)庫為克羅諾桿菌高通量鑒定與分型提供了一種新的手段。

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